蛋白样本制备、免疫组化、双向电泳、蓝色温和胶电泳系统分离蛋白质复合体、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹及磷酸化蛋白质检测
北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台可承接单项的蛋白质组学技术服务, 同时平台也开展规模化、高通量的蛋白质组学委托科研服务。
SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。
iTRAQ同位素标记相对定量和绝对定量分析
iTRAQ 采用液质联用的方法高通量地检测多组别间的蛋白质表达差异。蛋白质酶切成多肽后，用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的多肽经过液相色谱分离，进行一级和二级质谱分析，在
蛋白质串联质谱（MALDI-TOF/TOF）鉴定
ABI 5800 Plus MALDI TOF/TOF™是世界上最畅销的基质辅助激光解离飞行时间质谱系统，测定生物大分子的最大分子量可以达到600kDa，而且具有极高的灵敏度，能够分析fmol级别的蛋